חוקרים מאשרים מהירות, פשטות ורגישות לבדיקת COVID-19 חדשה

Share on facebook
Share on twitter
Share on linkedin
Share on telegram
Share on whatsapp
Share on email
פרסומת
X-ray_Promo1


חוקרים מאוניברסיטת בירמינגהם, בריטניה, אישרו את המהירות, הדיוק והפשטות של שיטת בדיקה חדשה ורגישה במיוחד ל- COVID-19 שניתן לפרוס במקומות בילוי, מסופי הגעה לשדה תעופה ובמסגרות מרוחקות בהן נמצאות מעבדות בדיקה קליניות. לא זמין.

המדענים השתמשו במחקר השוואות תלת -כיווני כדי לאשר כי שיטת תגובת ההגברה האקספוננציאלית (EXPAR) רגישה לא פחות אך מהירה יותר מאשר בדיקות PCR ו- LAMP המשמשות כיום במסגרות בית חולים. בדיקת COVID-19 של בירמינגהם, הנקראת RTF-EXPAR, נותנת זמן מדגם לאות של פחות מ -10 דקות, אפילו לרמות ויראליות נמוכות שבהן בדיקות הזרימה הרוחבי הנוכחיות פחות יעילות.

הפרופסורים טים דאפורן מבית הספר למדעים ביוסיים וג'ים טאקר מבית הספר לכימיה עבדו עם הסטודנט לתואר שני ג'ייק קרטר ופרופסור אנדרו בגס מהמכון לסרטן ומדעי הגנומה על המחקר, שפורסם היום ב PNAS.

הן בדיקות ה- PCR והן ה- LAMP מזהות RNA ויראלי, שיכול להיות קיים ברמות נמוכות במיוחד במקלחות שנלקחות מהפה ומהאף. בדיקות אלה משתמשות בתהליך דו-שלבי הכולל תחילה המרה ל- RNA ל- DNA (תהליך שנקרא שעתוק הפוך) ולאחר מכן 'מגביר' את החומר פעמים רבות כך שניתן לאתר אותו במדגם.

פרופסור טים דאפורן אמר: "הן שלבי התמלול ההפוך והן ההגברה מאטים את מבחני ה- COVID הקיימים המבוססים על זיהוי חומצות גרעין, בהשוואה לבדיקות אנטיגן, כגון זרימה לרוחב, שאין בהן שלבים אלה. עם זאת, בעוד שזה גורם לזרימה לרוחב. בדיקות מהירות יותר מאלו המבוססות על PCR ו- LAMP, בתמורה הן בדרך כלל פחות רגישות. בדיקה אידיאלית תהיה בדיקה רגישה ומהירה כאחד-הבדיקה שלנו, הנקראת RTF-EXPAR, משיגה מטרה זו.

RTF-EXPAR משיגה הישג זה בשתי דרכים-ראשית, צוות הבדיקה תכנן שלב המרה חדש ל- RNA ל- DNA המונע שעתוק הפוך, מה שהופך אותו ללא תמלול הפוך (RTF). שנית שלב ההגברה שלהם ליצירת האות הקריאה משתמש ב- EXPAR, תהליך הגברה DNA חלופי ל- PCR ו- LAMP.

פרופסור דאפורן הוסיף: "EXPAR מגביר את ה- DNA בטמפרטורה אחת, ובכך נמנע מצעדים ארוכים של חימום וקירור שנמצאו ב- PCR. עם זאת, בעוד LAMP משתמשת גם בטמפרטורה אחת להגברה, EXPAR הוא תהליך פשוט וישיר יותר, שבו הרבה יותר קטן גדילים מוגברים. זה הופך את EXPAR לטכניקת הגברת DNA מהירה עוד יותר מאשר לא רק PCR אלא גם LAMP ".

המחקר גילה כי שיטת RTF-EXPAR ממירה מתחת ל -10 גדילים של RNA למיליארדי עותקים של DNA תוך פחות מ -10 דקות, תוך שימוש במבחן סיר אחד התואם ציוד בסיסי יותר על השולחן מאשר זה המשמש בשיטות בדיקה עדכניות.

RTF-EXPAR גם הוכיח שיפורים משמעותיים הן במבחני PCR והן במבחני LAMP בזמן לאיתור איתות. בריכוזים נמוכים של RNA (7.25 עותקים/µL), זמן האיתות היה 42.67 (± 0.47) דקות עבור PCR, 11.25 (± 0.20) דקות עבור LAMP ו- 8.75 (± 0.35) דקות עבור EXPAR. בריכוזים גבוהים (1450 עותקים/µL) של RNA ויראלי, הזמן לאיתור אותות היה 34.00 (± 0.00) דקות עבור PCR, 11.25 (± 0.20) דקות עבור LAMP ו- 3.08 (± 0.42) דקות עבור EXPAR.

זיהוי הרצף האופטימלי היה בבירור שלב חשוב בפיתוח שיטת EXPAR, והרצף שהתגלה במחקר, הנובע מה- Orf1ab הגן בגנום SARS-CoV-2, הוכח כשימור בכל הגרסאות הנוכחיות של COVID. עם זאת, ניתן להתאים את שיטת RTF-EXPAR במהירות במידה ויצאו גרסאות חדשות, או לבדיקת פתוגנים ויראליים אחרים כגון שפעת, נגיף סינציאלי של הנשימה (RSV) או אבולה, כאשר נדרשת בדיקת מטופל קרוב כדי למנוע העברה נרחבת יותר.

המבחן נבדק במעבדה למחקר כירורגי באוניברסיטת ברמינגהאם. פרופסור אנדרו בגס, שצוותו ביצע את הבדיקה, אמר: "הבדיקה השתמשה בספוגיות המכילות טווח טיפוסי של נגיפים ויראליים שנראו במהלך המגיפה, והיה להן זמן חיתוך של שש דקות. הניתוח הראה כי הרגישות של RTF-EXPAR שקולה ל בדיקות PCR כמותיות, בעלות ערך ניבוי חיובי של 89%, וערך ניבוי שלילי של 93%. אנו מצפים לפרסם את מלוא תוצאות הבדיקה הזו בעתיד הקרוב ".

הצוות מחפש כעת שותפים מסחריים לרישוי מהיר, כדי להפוך את מבחן RTF-EXPAR לזמין ככל הניתן.

.



קישור לכתבת המקור – 2021-08-17 02:13:28

Share on facebook
Facebook
Share on twitter
Twitter
Share on linkedin
LinkedIn
Share on telegram
Telegram
Share on whatsapp
WhatsApp
Share on email
Email
פרסומת
תכנון תשתיות רפואיות

עוד מתחומי האתר