כלים חדשים חושפים איך גנים עובדים ותאים מתארגנים

פרסומת
MAGNEZIX מגנזיקס


חוקרים מאוניברסיטת ארהוס ומהמכון הטכנולוגי האיטלקי גילו כיצד חלבונים מסוימים יכולים להיצמד למבנים מיוחדים ב-RNA, הנקראים G-quadruplexes. בנוסף, הם פיתחו כלים חישוביים המסוגלים לחזות את האינטראקציות הללו בין חלבון ל-RNA. היכולת החדשה לחזות את האינטראקציות הללו יכולה לסייע לעבודה עתידית בהבנת המסלולים המולקולריים בתא ולסלול את הדרך לפיתוח תרופות המכוונות לחלבונים קושרים ל-RNA G-quadruplex, שנמצאו מעורבים במחלות כמו סרטן.

פרסומת

חלבונים הנקשרים ל-RNA חשובים בתהליכים רבים בתא ויכולים לתווך מגוון פונקציות ביולוגיות. מבנה מיוחד ב-DNA וגם ב-RNA, ה-G-quadruplex, הם אלמנטים רגולטוריים המעורבים בביטוי גנים גם ב-DNA וגם ב-RNA. בעבודה הנוכחית החוקרים משתמשים בתחזיות תיאורטיות ובניסויים בביולוגיה מולקולרית כדי להראות שחלבונים רבים הקשורים לכרומטין נקשרים ל-RNA G-quadruplexes. בעזרת מידע זה הם יכולים לסווג חלבונים על סמך הפוטנציאל שלהם לקשור RNA G-quadruplexes.

המחקר משתמש בשילוב של זיהוי ניסיוני של חלבונים קושרים ל-RNA G-quadruplex ושיטות חישוביות כדי לבנות כלי חיזוי המזהה את ההסתברות שחלבון נקשר ל-RNA G-quadruplexes. הממצאים מראים שחלבונים חזויים מראים רמה גבוהה של הפרעת חלבון והידרופיליות, דבר המצביע על מעורבות הן בתעתיק והן בהפרדת פאזות לאברונים חסרי ממברנה.

הקבוצה של Ulf Ørom הראתה בעבר שלחלבונים כפולים RNA-DNA יש סבירות מעורבות בתגובת הנזק ל-DNA, תוך קישור בין תכונות ה-DNA ו-RNA למספר חלבונים. במחקר החדש, החוקרים הרחיבו את הידע של חלבונים קושרים ל-RNA כדי לזהות חלבונים קושרים ל-RNA G-quadruplex.

החוקרים פיתחו גם כלי חישובי להערכת פוטנציאל הקישור ל-RNA G-quadruplex של חלבונים שניתן לגשת אליהם ב- http://service.tartaglialab.com/new_submission/clever_G4_classifier.

בעזרת התוצאות החדשות הללו, החוקרים מזהים תכונות של אינטראקציות חלבון-RNA, ומספקים אמצעים לזהות תכונות קושרות של G-quadruplex שיכולות להיות ממוקדות טיפולית במחלה.

הממצאים פורסמו זה עתה ב תקשורת טבע.



קישור לכתבת המקור – 2024-04-04 00:10:42

Facebook
Twitter
LinkedIn
Telegram
WhatsApp
Email
פרסומת
תכנון תשתיות רפואיות

עוד מתחומי האתר