כלי חדש עוזר לפענח התנהגות גנים

פרסומת
MAGNEZIX מגנזיקס


מדענים חקרו בהרחבה את המבנה והרצף של החומר הגנטי ואת האינטראקציות שלו עם חלבונים בתקווה להבין כיצד הגנטיקה והסביבה שלנו מתקשרות במחלות. מחקר זה התמקד בחלקו ב'סימנים אפיגנטיים', שהם שינויים כימיים ל-DNA, RNA והחלבונים הקשורים (הידועים בשם היסטונים).

פרסומת

סימנים אפיגנטיים משפיעים על מתי וכיצד גנים מופעלים או מכבים. הם יכולים גם להדריך תאים כיצד לפרש ולהשתמש במידע גנטי, להשפיע על תהליכים תאיים שונים. לכן שינויים בסימנים האפיגנטיים משפיעים באופן משמעותי על ויסות הגנים ותפקודים התאיים, מה שאומר שהם עשויים לתרום למחלה. על ידי לימוד סימנים אפיגנטיים, חוקרים יכולים להבהיר את תפקידם בבריאות ובמחלות ולגלות אפיקים חדשים לטיפול.

בעוד שחוקרים יכולים לזהות ולהשוות סימנים אפיגנטיים, הבנת המתאם בין שינויים ספציפיים ואיך גנים פועלים נותרה מאתגרת. כדי לעזור להתגבר על זה, ד"ר דן אוטאן וואנג וד"ר קנדארפ ג'ושי יצרו כלי חדש בשם epidecodeR. הכלי הידידותי למשתמש, שפורסם ב תדריכים בביואינפורמטיקה, מאפשר לביולוגים לבדוק במהירות אם שינוי משפיע על התגובה של גן במצבים ספציפיים.

"אם יימצא מתאם חיובי, זה יכול להניע מדענים לאשר את הממצאים, לעזור להם להבין את תפקידם של שינויים גנים אלה במצבים שונים, כולל סרטן והפרעות נוירולוגיות", מסביר ג'ושי, חוקר במכון לחומר תא משולב מדעים (iCeMS).

הצוות השתמש בשיטות סטטיסטיות כדי לסווג קבוצות של גנים על סמך כמה שינויים היו להם. הם הראו כי EpidecodeR יכול לחזות את תפקידם של שינויים ספציפיים, כמו שינוי חלבונים מסוימים או שימוש בתרופות, וכיצד אלה יכולים להשפיע על פעילות הגנים.

"השתמשנו ב-epidecodeR כדי לחזות בהצלחה כיצד חלבון בשם היסטון דאצטילאז משפיע על פעילות הגנים", אומר וואנג, פרופסור אורח ב-iCeMS שהוביל את המחקר. "מצאנו גם כי epidecodeR יעיל בזיהוי חומרים שיכולים לחסום חלבון אחר, הנקרא RNA demethylase, וחקרנו כיצד שינויים בחלבונים הנקראים היסטונים עשויים להיות קשורים לשימוש בסמים".

החוקרים מתכננים לערוך מחקרים נוספים כדי לשפר את הדיוק והספציפיות של epidecodeR. "אנחנו רוצים לכלול פרטים נוספים לגבי היכן, איך וכמה שינויים מתרחשים בגנים", אומר ג'ושי. "ככל שהנתונים הופכים מורכבים יותר, אנו גם שואפים לספק למשתמשים מבחנים סטטיסטיים שונים כדי לשפר את היכולות של הכלי".



קישור לכתבת המקור – 2024-02-28 20:20:43

Facebook
Twitter
LinkedIn
Telegram
WhatsApp
Email
פרסומת
X-ray_Promo1

עוד מתחומי האתר