לזכרה: מותה של אשתו דוחף מדען נתונים לשפר את המערכת

פרסומת
MAGNEZIX מגנזיקס


אמיר בהמני, דוקטורט, הגיע לשפל נואש בחייו בעקבות מותה של אשתו, סומירה, בשנת 2014. הרופאים טעו בכאבה הנורא של כיס מרה מודלקת, החמיצה את הסימנים של סרטן ממאיר.

פרסומת

"אם הם היו אוספים את הנתונים, הם היו רואים שמשהו קורה בפנים, שיש שינוי גדול שמתרחש עם חולי סרטן", אמר בהמני, מנהל Stanford Deep Data Research Center. "אולי הם היו מסוגלים לתפוס את זה מוקדם ולתת לה סיכוי טוב יותר."

בצערו, הוא הבין עד כמה מדע הנתונים יכול להשפיע על הרפואה ועלול להציל חיים. אז הוא החליט לעזור לסגור את הפער הזה ולקרב את הדיסציפלינות למען מימוש גישת רפואה מדויקת – מהסוג שיכול היה לעשות את ההבדל עבור סומירה.

"אנחנו רוצים ליצור שפה משותפת בין מהנדסים, ביולוגים ורופאים", אמר בהמני, מדען מחשבים בעל ביצועים גבוהים. "אנחנו לא צריכים לדעת הכל, אבל אנחנו צריכים לדעת מספיק כדי לתקשר ביעילות אחד עם השני."

אנחנו לא צריכים לדעת הכל, אבל אנחנו צריכים לדעת מספיק כדי לתקשר ביעילות זה עם זה.

אמיר בהמני

בהמני היה מוכן להקדיש את חייו לרפואה. אבל, כמהגר איראני ללא אמצעים כלכליים, הוא עמד בפני מכשולים גדולים. הוא היה הראשון בכיתתו באיראן שהשיג מלגה בחו"ל – אפשרות כמעט בלתי מתקבלת על הדעת – להשיג מלגת מחקר באוניברסיטת צפון קרוליינה סטייט, שם קיבל תואר דוקטור במדעי המחשב.

ואחרי שנאבק להשיג אשרות, סומירה, שאותה הכיר כסטודנט לתואר ראשון, הצליח להצטרף אליו כעוזר מחקר בהנדסה ב-NC State. יחד הם חלמו להקים משפחה באמריקה וליצור לעצמם חיים טובים יותר.

ואז הגיעו כאבי הצד הנוראיים ופתאום הסיוט הגרוע ביותר של בעל צעיר התגלגל לנגד עיניו. סומירה הייתה רק בת 26 במותה.

אבל בהמני מתאבל לא יכול היה לצפות את האתגרים שיעמדו בפניו להמשיך לבד עם החלום האמריקאי המשותף שלהם. לאחר שחזר לאיראן כדי לקבור את סומירה, הוא אמר שהוא נמלט בקושי מגיוס לצבא האיראני ולאחר מכן גם כמעט איבד את מלגת המחקר שלו בגלל עיכובים בחידוש האשרה שלו, שעוכבה על ידי הרשויות האיראניות.

"בחצי שנה איבדתי הכל. איבדתי את החבר הכי טוב שלי – אשתי – ועכשיו פחדתי שאני הולך לאבד את הקריירה שלי", אמר. ואז, מכת מזל: הוא קיבל פתק משגרירות ארה"ב בארמניה שהוויזה שלו ממתינה לו שם.

מחבקת את האתגרים

עוד בארצות הברית, חיכו לו גם בדיקות נוספות. הרקע האיראני של בהמני מנע ממנו לעבוד עם מדעני מעבדה לאומית בארה"ב במחשוב בעל ביצועים גבוהים. למרבה המזל, מנטור הכיר אותו לחוקרים במכון הסרטן של דיוק בבית הספר לרפואה של אוניברסיטת דיוק.

זה יוביל אותו לפריצה הגדולה הראשונה שלו: מענק של 10,000 דולר של Amazon Web Services (AWS) באמצעות תוכנית למלחמה בסרטן באמצעות שירותי ענן, שיטה חסכונית לאחסון ועיבוד כמויות גדולות של נתונים. הוא המשיך בשיתוף פעולה עם חוקרי הדוכס כדי לפרסם את מאמר המחקר הראשון שלו לסרטן ב-2015 על טכניקה סטטיסטית של אש מהירה לשייך סוגי סרטן מסוימים למוטציות ספציפיות.

ההקדמה הזו לגנטיקה הוציאה את בהמני לקורס מרתק, אם כי קשה. כמדען מחשבים, עולם הגנטיקה נראה מרתיע. היה כל כך הרבה מה ללמוד. הוא זוכר ששמע את המונח "RNA שליח" ממשתף הפעולה שלו מהדוכס בשלב מוקדם.

תמונה מאת ג'ים גנסהיימר

לא ידעתי מה זה (מסנג'ר RNA). זה מפחיד כשאתה בתחום אחר.

אמיר בהמני

"לא ידעתי מה זה", אמר. "זה מפחיד כשאתה בתחום אחר."

כדי להרחיב את הידע שלו ולאמץ את האתגר, הוא קיבל התמחות באותו קיץ ב- Illumina Inc., שבונה מערכות מחשוב לניתוח גנטי. הוא התקבל לעבודה בחברת פאלו אלטו, קליפורניה, בשנה שלאחר מכן ולאחר מכן הצטרף סטנפורד רפואה בשנת 2017 כמדען נתונים ביו-רפואי שעובד תחת חסותו של מייקל סניידרPhD, ה-Stanford W. Asherman, פרופסור FACS לגנטיקה ויו"ר המחלקה לגנטיקה.

באותה שנה, סניידר הצליח לאבחן בעצמו את מחלת ליים לפני שהיו לו תסמינים כלשהם על ידי שימוש במכשיר לביש שהראה סימנים מדידים של מאבק פנימי עם פתוגן. סניידר פרסם מחקר גדול על התהליך, שכלל איסוף כמויות אדירות של נתונים – שני פדא-בייט או שני מיליון גיגה-בייט.

בהמני אמר שברור שהם צריכים דרך טובה יותר לאחסן ולעבד את כל הנתונים האלה, אז הוא פנה למחשוב ענן כדי לעזור לבנות מערכת שנקראת My Personal Health Dashboard (MyPHD) שמאז סייע ליותר מ-30 מחקרי מחקר שכללו למעלה מ-10,000 משתתפים.

באמצעות הטכנולוגיה, הוא ומשתפי הפעולה שלו – כולל רופאים, גנטיקאים ומדעני מחשב – פיתחו שני אלגוריתמים כדי לזהות זיהום ב-COVID-19 עד שבעה או שמונה ימים לפני הופעת התסמינים, בהתבסס על שינויים פנימיים בגוף. הם גם המציאו מערכת התרעה על COVID-19 כדי להזהיר אנשים מוקדם על זיהום מתפתח. זה עובד פורסם בשנת 2022 ב רפואת טבע.

חינוך בדיוק

בהמני רצה להרחיב את קהילת האנשים שיכולים לעבוד על הבעיות המורכבות והרב-תחומיות הללו. אז, בעזרתו של סניידר, הוא פיתח א קוּרס, מחשוב ענן לביולוגיה ובריאותשכללה הרצאות של מנכ"ל גוגל לשעבר, אריק שמידט, ומאירים נוספים בתחום.

"תמיד האמנתי שכדי לספק רפואה מדויקת, אנחנו צריכים להתמודד עם חינוך מדויק", אמר בהמני, כיום מרצה במחלקה לגנטיקה. "אם מישהו ברחבי העולם רוצה לתרום לרפואה, צריכה להיות לו הזדמנות".

תמונה מאת ג'ים גנסהיימר

לאחרונה, הוא פיתח תוכנית תעודה חדשה, יסודות הרפואה המדויקת ומחשוב ענן, תכנית לימודים בקצב עצמי בנושאי רפואה, גנטיקה ומדעי נתונים עבור תלמידי תיכון, מכללות ותואר שני. זה מתחיל בשיעורים על פרטיות נתונים ועובר לנושאים כמו תכנות, סטטיסטיקה, מחשוב ענן, בינה מלאכותית, הדמיה רפואית, גנומיקה ומכשירים לבישים.

בהמני נלהב להפוך את ההזדמנויות החינוכיות הללו בחינם לסטודנטים מוחלשים – אלה עם הכנסה של פחות מ-70,000 דולר – מכיוון שהוא מאמין שלמתאמנים הללו יש הרבה מה להציע לעולם הרפואה.

יתרה מכך, הוא רוצה להחזיר למערכת שבה אנשים כמוהו – מהגר איראני מרקע צנוע – יכולים לשגשג כאשר ניתנות להם הזדמנויות שלא היו לו אחרת. ה תכנית מוצע דרך עמותה שבגינה הוא מבקש תמיכה נוספת.

כדי באמת לבנות אמון ולהקים מערכות בריאות כוללניות, עלינו להכין יותר חוקרים ומומחים מקהילות מוחלשות.

אמיר בהמני

"כדי לבנות אמון באמת ולהקים מערכות בריאות כוללניות, עלינו להכין יותר חוקרים ומומחים מקהילות מוחלשות. אנחנו רוצים קולות שונים מקהילות שונות", אמר.

תוך כדי כך הוא מקווה להציל מטופלים נוספים מהסוג של פספוסים שלקחו ממנו את אשתו.

"כל זה נעשה לזכרה", אמר. "אולי נוכל למנוע טרגדיות כאלה עבור אחרים על ידי גילוי מחלות אלה הרבה יותר מוקדם".

תמונה ראשית: ג'ים גנסהיימר



קישור לכתבת המקור – 2024-02-15 22:53:48

Facebook
Twitter
LinkedIn
Telegram
WhatsApp
Email
פרסומת
MAGNEZIX מגנזיקס

עוד מתחומי האתר