מאיר קצת אור על הפרוטאום הלא ברור: כימופרוטאומיקה מצייר את נוף היעד של תרופות HDAC

Share on facebook
Share on twitter
Share on linkedin
Share on telegram
Share on whatsapp
Share on email
פרסומת
MAGNEZIX מגנזיקס


מעכבי היסטון דאצטילאז (HDAC) הם סוג של תרופות המשמשות באונקולוגיה. צוות מחקר בינלאומי הכולל מדענים מהאוניברסיטה הטכנית של מינכן (TUM), אוניברסיטת קורנל באיתקה (ארה"ב), המרכז לחקר הסרטן הגרמני (DKFZ) בהיידלברג ואוניברסיטת מרטין לותר בהאלי-וויטנברג חקר כעת את ההשפעות של כמה HDAC תרופות ביתר פירוט. המדענים חקרו אם התרופות הללו משפיעות על חלבונים אחרים מלבד ה-HDACs שהם נועדו לעכב.

"כדי לעשות זאת, דה-קונבולוציה של מטרה על ידי פרוטאומיקה כימית היא השיטה הרצויה. לפיכך, יצרנו תחילה כלים כימיים חדשים – מה שנקרא מטריצות זיקה – שיאפשרו לנו ליצור פרופיל שיטתי של ה-HDACs", מסביר ד"ר גיום מדארד. ראש קבוצה לפרוטאומיקה כימית בקתדרה של TUM לפרוטאומיקה וביואנליטיקה בראשות פרופ' ברנהרד קוסטר.

פרופיל תרופות HDAC על ידי פרוטאומיקה כימית

"ערכתי פרופיל של 53 תרופות ורובן, אבל לא כולן, פגעו ביעד ה-HDAC המיועד להן", אמרה סברין לכנר, מועמדת לדוקטורט בבית הספר למדעי החיים של TUM. "עם זאת, היו כמה הפתעות. תרופות ששימשו במאות מחקרים מדעיים לא היו סלקטיביות כפי שהניחו. לרבים היו מטרות נוספות שלא היו ידועות קודם לכן.

תוצאות אלו מדגישות את כוחן של גישות פרוטאומיות, שכן הן יכולות לחקור את הקישור לאלפי חלבונים בבת אחת. לבסוף, הצוות זיהה מספר מולקולות עם סלקטיביות יוצאת דופן, מה שהפך אותן למעכבי הבחירה למחקרים מדעיים עתידיים.

נוף היעד של תרופות HDAC

"הממצא הבלתי צפוי ביותר היה ש-MBLAC2 הוא מחוץ למטרה עבור מחצית מהמולקולות המצופות", ממשיך לכנר. חלבון זה אינו מאופיין היטב. במקרה, הצוות של פרופ' מורן לינדר בקורנל חקר אותו במקביל. שתי הקבוצות שיתפו פעולה ואישרו שהחלבון אכן מפריע בביצוע תפקידו בנוכחות התרופות.

בעבודה עם קבוצתו של פרופ' מייקל פפל ב-TUM, לכנר בדק את ההשפעות הפנוטיפיות הבלתי מוסברות הנרמזות של תרופות מסוימות והוכיח שעיכוב MBLAC2 או הרס מוביל להצטברות שלפוחיות חוץ-תאיות בחלל החוץ-תאי. שלפוחיות חוץ-תאיות הן חלקיקים קטנים התוחמים בקרום המופרשים על ידי תאים ומועברים דרך כל הגוף כדי להעביר ביו-מולקולות ומידע בין תאים ורקמות.

מחקר יסודי להכנת האפידרוגים של מחר

"אנחנו נרגשים כי חשפנו שחקן חדש בתחום הביולוגיה הזה, שמקיף במיוחד אקסוזומים, הממלאים תפקידים מכריעים בנוירולוגיה, אימונולוגיה ואונקולוגיה", מסביר מדארד. "אנחנו מתכננים כעת מולקולות שפוגעות רק ב-MBLAC2 כדי שנוכל לחקור את החלבון הלא ברור הזה במגוון מערכות מודל."

מחקר זה יהיה שימושי למי שרוצה להשתמש במעכבי HDAC לבדיקת ביולוגיה או לשימוש טיפולי. זה עוזר בבחירת הכלי הכימי הנכון. זהו גם קבוצה חשובה של נתונים עבור כימאים רפואיים שצריכים להבין כיצד מבנים כימיים קשורים לעוצמה וסלקטיביות לייצור אפידרופים של מחר.

מקור הסיפור:

חומרים המסופק על ידי האוניברסיטה הטכנית של מינכן (TUM). הערה: ניתן לערוך את התוכן לפי הסגנון והאורך.



קישור לכתבת המקור – 2022-06-29 23:10:54

Share on facebook
Facebook
Share on twitter
Twitter
Share on linkedin
LinkedIn
Share on telegram
Telegram
Share on whatsapp
WhatsApp
Share on email
Email
פרסומת
תכנון תשתיות רפואיות

עוד מתחומי האתר